ПРОГРАММНАЯ СИСТЕМА DipolarCalc ДЛЯ ОЦЕНКИ ПОЛЯРИЗОВАННОСТИ БИОЛОГИЧЕСКИХ МОЛЕКУЛЯРНЫХ СТРУКТУР

Обложка

Цитировать

Полный текст

Открытый доступ Открытый доступ
Доступ закрыт Доступ предоставлен
Доступ закрыт Только для подписчиков

Аннотация

Представлена уникальная программная система DipolarCalc, позволяющая вычислить поляризованность биомолекул через суммарный дипольный момент химических связей «функциональных топологических атомов» (ФТА). Программа реализует удобный пользовательский интерфейс, обеспечивающий интуитивный ввод данных и визуализацию результатов расчетов, а также использует аналитические выражения, позволяющие проводить точные вычисления в реальном времени. Представленный программный комплекс ориентирован на использование в вычислительной биологии и предоставляет исследователям удобный инструмент для моделирования внутримолекулярного и межмолекулярного взаимодействия биологических молекулярных структур.

Об авторах

И. К. Ильин

Московский государственный университет имени М.В. Ломоносова

Email: ilia.ilin.k@gmail.com
Москва, Россия

Ю. А. Усс

Московский государственный университет имени М.В. Ломоносова

Email: ussyuri@gmail.com
Москва, Россия

М. В. Шамолин

Московский государственный университет имени М.В. Ломоносова

Email: shamolin@rambler.ru
Москва, Россия

Л. А. Янько

Московский государственный университет имени М.В. Ломоносова

Email: leanidyanko@yandex.ru
Москва, Россия

Список литературы

  1. Pauling L. The Nature of the Chemical Bond and the Structure of Molecules and Crystals: An Introduction to Modern Structural Chemistry. Cornell University Press, 1960. 644 p.
  2. Ильин И.К., Янько Л.А., Усс Ю.А. Про граммная система DipolarCalc, 2025. https://github.com/ilia-ilin/DipolarCalc.git
  3. Никифоров А.И., Садовников Р.В. Примене ние методов параллельного программиро вания для моделирования потокоотклоня ющих технологий на компьютерах с ги бридной архитектурой // Программирова ние. 2019. № 1. С. 43–51.
  4. Аветисян А.И., Гайсарян С.С., Самоваров О.И. Возможности оптимального выполне ния параллельных программ, содержащих простые и итерированные циклы на неод нородных параллельных вычислительных системах с распределенной памятью // Программирование. 2002. № 1. С. 38–54.
  5. Морозов Д.Н., Трапезникова М.А., Четверуш кин Б.Н., Чурбанова Н.Г. Моделирование задач фильтрации на гибридных вычисли тельных системах // Матем. моделирование. 2012. Т. 24. № 10. С. 33–39.
  6. Allred A. L. (1961). Electronegativity values from thermochemical data // Journal of Inorganic and Nuclear Chemistry. 1961. V. 17(3-4). Р. 215–221.
  7. Норманская Ю.В., Борисенко О.Д., Белоборо дов И.Б., Аветисян А.И. Программная си стема LingvoDoc и возможности, которые она предлагает для документирования и ана лиза орбско-угорских языков // Доклады РАН. Математика, информатика, процессы управления. 2022. T. 504. № 1. С. 60–82.
  8. Xiaoming H. The application of queuing theory in harbour programming [J] // Journal of Qingdao university engineering & Technology edition. 1996. № 3.

Дополнительные файлы

Доп. файлы
Действие
1. JATS XML

© Российская академия наук, 2025