Search and verification of  Betula nana L.  hybrid samples in the Urals

S. O. Medvedeva; Медведева С. О.; O. E. Cherepanova; Черепанова О. Е.; I. V. Petrova; Петрова И. В.; A. Yu. Teptina; Тептина А. Ю.

doi:10.31857/S2686738925020047

Поиск и верификация гибридных образцов Betula nana L. На Урале

Авторы: Медведева С.О.¹, Черепанова О.Е.¹, Петрова И.В.¹, Тептина А.Ю.²
Учреждения:
1. Ботанический сад УрО РАН
2. ФГАОУ ВО “Уральский федеральный университет имени первого Президента России Б.Н. Ельцина”
Выпуск: Том 521, № 1 (2025)
Страницы: 193-197
Раздел: Статьи
URL: https://vietnamjournal.ru/2686-7389/article/view/684004
DOI: https://doi.org/10.31857/S2686738925020047
ID: 684004

Цитировать

Полный текст

Открытый доступ
Доступ закрыт

Доступ предоставлен
Доступ закрыт

Только для подписчиков

Аннотация
Полный текст
Об авторах
Список литературы
Дополнительные файлы
Статистика

Аннотация

С помощью метода проточной цитометрии верифицированы гибридные образцы в популяциях B. nana, большая часть которых выявлена в северной части Уральских гор. Анализ нуклеотидных последовательностей региона ITS1, полученных по методу Сэнгера, показал низкую дифференциацию видов B. nana и B. Pubescens, связанную с текущими и предковыми процессами гибридизации. Анализ внутригеномного полиморфизма последовательностей ITS1 с помощью технологии Illumina показал наличие рДНК как B. nana, так и B. pubescens в геноме межвидовых гибридов первого поколения.

Ключевые слова

рДНК, ITS1, береза карликовая, береза пушистая, NGS, проточная цитометрия

Полный текст

Список литературы

Медведева С.О., Черепанова О.Е. Таксономические вопросы рода Betula // Сибирский лесной журнал. 2023. № 2. C. 65–75
Anamthawat-Jónsson, K. Hybrid introgression: the outcomes of gene flow in birch // ScienceAsia. 2019. V.45. No. 3. P. 203
Cherepanova O., Medvedeva S., Filippov E. et al. Biodiversity Evolution of a Shrub Betula nana L. Populations in the Urals // International Journal of Forestry Research. 2024. 2644583.
White T.J., Bruns T., Lee S., et al. Amplification and direct sequencing of fungal ribosomal RNA genes for phylogenetics. In: Innis M.A., Gelfland D.H., Sninsky J.J., White T.J., eds. PCR protocols: a guide to methods and applications. New York: Academic Press, 1990.
Callahan B.J., McMurdie P.J., Rosen M.J., et al. DADA2: High-resolution sample inference from Illumina amplicon data // Nature Methods. 2016. No. 13.
Anamthawat-Jónsson K., Thórsson T., Temsch E. M. et al. Icelandic Birch Polyploids — The Case of a Perfect Fit in Genome Size // Journal of Botany. 2010. 347254.
Jetlund S. Introgressive hybridization between the birch species (Betula pubescens ssp. tortuosa) and Betula nana in the mountains in Gudbrandsdalen, Norway // Norw J Agr Sci. 1994. No. 18, P. 15–18.
Wang N., McAllister H.A., Bartlett P.R. et al. Molecular phylogeny and genome size evolution of the genus Betula (Betulaceae) // Ann Bot-London. 2016. No. 117
Sun K., Ma R., Chen X., Li C. et al. Hybrid origin of the diploid species Hippophae goniocarpa evidenced by the internal transcribed spacers (ITS) of nuclear rDNA // Belg. J. Bot. 2013. V.136. No. 1. P. 91-96
Osuna-Mascaro C., de Casas R. R., Berbel M., et al. Lack of ITS sequence homogenization in congeneric plant species with different ploidy levels // bioRxiv. 2022.
Пунина Е.О., Мачс Э.М., Носов Н.Н., и др. NGS-секвенирование (Illumina) как инструмент для определения геномного состава и таксономической принадлежности видов и межвидовых гибридов на примере злаков трибы Ячменевых (Hordeeae) // Проблемы ботаники Южной Сибири и Монголии, 2023. Т. 22, № 2. С. 276–286
Belyakov E.A., Mikhaylova Y.V., Machs E.M., et al. Hybridization and diversity of aquatic macrophyte Sparganium L. (Typhaceae) as revealed by high-throughput nrDNA sequencing // Scientific Reports. 2022. V. 12. No. 1. P. 21610.
Turchetto C., Segatto A.L., Beduschi J., Bonatto S.L., Freitas L.B. Genetic differentiation and hybrid identification using microsatellite markers in closely related wild species // AoB Plants. 2015. V. 7.