Исследование полиморфного варианта гена холодового рецептора TRPM8 (rs7593557) в 15 популяциях Алтае-Саянского региона, Западной Сибири и Дальнего Востока

Обложка

Цитировать

Полный текст

Открытый доступ Открытый доступ
Доступ закрыт Доступ предоставлен
Доступ закрыт Только для подписчиков

Аннотация

Проведен анализ гена терморецептора TRPM8 (rs7593557) у населения (15 выборок), проживающего в разных регионах Северной Азии, Алтае-Саянского нагорья, а также в Канаде. Высокие частоты редкого генотипа и аллеля в популяциях Алтае-Саянского региона и Западной Сибири обнаружены у теленгитов (22.2 и 41.7% соответственно), низкие – у сибирских татар (3.2 и 18.5% соответственно), а среди народов севера Сибири и Дальнего Востока высокая частота обнаружена у нанайцев (22.2 и 42.6% соответственно), а низкая – у якутов (1.1 и 10.9% соответственно). Отклонений от равновесия Харди–Вайнберга не обнаружено. Проведена трансассоциация полиморфизмов генов TRPV1, TRPA1 и TRPM8 с помощью метода регрессионного анализа в 14 популяциях. Из всех трех пар только в одной – TRPV1/TRPM8 была выявлена положительная корреляция (0.55, df = 13, P-value = 0.032). В парах TRPV1/TRPA и TRPA1/TRPM8 выявлена отрицательная корреляция (–0.545, df = 13, P-value = 0.048) и (–0.46, df = 13, P-value = 0.097). Полученные нами данные свидетельствуют о том, что изученные полиморфные варианты генов TRPV1 и TRPM8 скоррелированы между собой и отрицательно скоррелированы с TRPA. Полученные результаты возможно свидетельствуют о коэволюции данных генов. Ранее было показано, что TRPV1, так же как и TRPM8, выявлен с высокой частотой в популяции нанайцев. Вероятно, эти две мутации пришли одновременно с Восточной Азии и распространились по территории России, тем самым и объясняется то, что они скоррелированы между собой положительно.

Полный текст

Доступ закрыт

Об авторах

М. А. Губина

Федеральный исследовательский центр, Институт цитологии и генетики Сибирского отделения Российской академии наук

Автор, ответственный за переписку.
Email: marina@bionet.nsc.ru
Россия, Новосибирск, 630090

В. Н. Бабенко

Федеральный исследовательский центр, Институт цитологии и генетики Сибирского отделения Российской академии наук

Email: marina@bionet.nsc.ru
Россия, Новосибирск, 630090

Е. Ю. Губина

Первый московский государственный медицинский университет им. И.М. Сеченова

Email: marina@bionet.nsc.ru
Россия, Москва, 119991

Список литературы

  1. Montell C., Rubin G.M. Molecular characterization of the Drosophila TRP locus: A putative integral membrane protein required for phototransduction // Neuron. 1989. V. 2. P. 1313–1323. https://doi.org/10.1016/0896-6273(89)90069-x
  2. Diaz-Franulic I., Poblete H., Miño-Galaz G. et al. Allosterism and structure in thermally activated receptor potential channels // Annu. Rev.Biophys. 2016. V. 5. P. 371–398. https://doi.org/10.1146/annurev-biophys-062215-011034
  3. Talavera K., Yasumatsu K., Voets T. et al. Heat activation of TRPM5 underlies thermal sensitivity of sweet taste // Nature. 2005. V. 438. P. 1022–1025. https://doi.org/10.1038/nature04248
  4. Nilius B., Owsianik G., Voets T. Transient receptor potential cation channels in disease // Physiol. Rev. 2007. V. 87. P. 165–217. https://doi.org/10.1152/physrev.00021.2006
  5. Jordt S.E., McKemy D.D., Julius D. Lessons from peppers and peppermint: The molecular logic of thermosensation // Curr.Opin.Neurobiol. 2003. V. 13. P. 487–492. https://doi.org/10.1016/s0959-4388(03)00101-6
  6. Laursen W.J., Anderson E.O., Hoffstaetter L.J. et al. Species-specific temperature sensitivity of TRPA1 // Temperature (Austin). 2015. V. 11. P. 214–226. https://doi.org/10.1080/23328940.2014.1000702
  7. Губина М.А., Орлов П.С., Бабенко В.Н. и др. Полиморфизм генов терморецепторов TRPV1 и TRPA1 человека в популяциях Алтае-Саянского региона и Дальнего Востока // Генетика. 2018. Т. 54. № 2. 243–252.
  8. http://www.ncbi.nlm.nih.gov/variation/tools/1000genomes/?q=rs13268757.
  9. Key F.M., Abdul-Aziz M.A., Mundry R. et al. Human local adaptation of the TRPM8 cold receptor along a latitudinal cline // PLoS Genetics. 2018. V. 14. № 5. P. 1–22. https://doi.org/10.1371/journal.pgen.1007298
  10. Wei E., Seid D. AG-3-5: A chemical producing sensation of cold // J. Pharm. Pharmacol. 1983. V. 35. P. 110–112.
  11. McKemy D.D., Neuhausser W.M., Julius D. Identification of a cold receptor reveals a general role for TRP channels in thermosensation// Nature. 2002. V. 416. № 6876. P. 52–58. https://doi.org/10.1038/nature719
  12. Tsavaler L., Shapero M.H., Morkowski S., Laus R. Trp-p8, a novel prostate-specific gene, is up-regulated in prostate cancer and other malignancies and shares high homology with transient receptor potential calcium channel proteins //Cancer Res. 2001. V. 61. P. 3760–3769.
  13. Patapoutian A., Peier A., Story G., Viswanath V. Thermo TRP channels and beyond: Mechanisms of temperature sensation // Neuroscience. 2003. V. 4. P. 529–539. https://doi.org/10.1038/nrn1141
  14. Nealen M.L., Gold M.S., Thut P.D., Caterina M.J. TRPM8 mRNA is expressed in a subset of cold-responsive 148 trigeminal neurons from rat // J. Neurophysiol. 2003. V. 90. № 1. P. 515–520. https://doi.org/10.1152/jn.00843.2002
  15. Yee N.S., Zhou W., Lee M. Transient receptor potential channel TRPM8 is overexpressed and required for cellular proliferation in pancreatic adenocarcinoma // Cancer Lett. 2010. V. 297. P. 49–55. https://doi.org/10.1016/j.canlet.2010.04.023
  16. Maniatis T., Fritsch E.E., Sambrook J. Molecular Cloning: A Laboratory Manual. N.Y.: CSHL, 1982.
  17. Ruhlen M.A. Guide to the World’s Languages. Classification. London: Edward Arnold, 1991.
  18. Greenberg J. Indo-European and Its Closest Elatives: The Eurasiatic Family: Grammar. Stanford, CA: Stanford University Press. 2000.
  19. Slatkin M. An exact test for neutrality based on the Ewens sampling distribution // Genet. Res. 1994. V. 64. P. 71–74. https://doi.org/10.1017/s0016672300032560
  20. Excoffier L., Laval G., Schneider S. Arlequin (version 3.0): An integrated software package for population genetics dataanalysis //Evol.Bioinform. Online. 2005. V. 1. P. 47–50.
  21. XLStat.com
  22. Потапова Т.А., Юдин Н.С., Бабенко В.Н. и др. Полиморфизм гена холодового рецептора TRPM8 в этнических группах Сибири и Дальнего Востока // Вестник ВОГиС. 2008. Т. 12. № 4. С. 749–754.
  23. Потапова Т.А., Ромащенко A.Г., Юдин Н.С., Воевода M.И. Этноспецифическое распределение вариантов гена TRPM8 в евразийских популяциях: знаки отбора // Вавилов. журнал генет. и селекции. 2020. Т. 24. № 3. С. 292–298. https://doi.org/18699/VJ20.45-o

Дополнительные файлы

Доп. файлы
Действие
1. JATS XML
Скачать
2. Рис. 1. Многомерное шкалирование попарных генетических расстояний в 15 исследованных популяциях.

Скачать (78KB)
Метаданные
3. Рис. 2. График линейной регрессии частот полиморфизмов генов TRPV1/TRPM8 (а), TRPV1/TRPA (б) и TRPA/TRPM8 (в) в 14 популяциях.

Скачать (255KB)
Метаданные

© Российская академия наук, 2024