Индивид волынцевского времени из Куриловки: первые археогенетические данные

Обложка

Цитировать

Полный текст

Открытый доступ Открытый доступ
Доступ закрыт Доступ предоставлен
Доступ закрыт Доступ платный или только для подписчиков

Аннотация

Несмотря на достижения последних лет в области палеогеномных исследований, генетические особенности и разнообразие раннеславянского населения остаются неисследованными в связи с распространенным у древних славянских племен обрядом трупосожжения. Поэтому ценна каждая находка антропологического материала из раннеславянских памятников. Таким уникальным объектом является череп из жилища, отнесенного к волынцевской культуре, памятника Куриловка 2 (Курская обл.), который датируется концом VII – первой половиной/серединой VIII в. Из зуба была выделена ДНК и использована для проведения генетического анализа. Мы реконструировали полную последовательность митохондриальной ДНК и определили, что она принадлежит к европейской гаплогруппе H1b. Результаты филогенетического анализа свидетельствуют об общих материнских линиях индивида из Куриловки со средневековыми и современными европейскими образцами и позволяют предположить общность раннеславянских и северо-западных европейских митохондриальных линий.

Об авторах

Т. В. Андреева

Центр генетики и наук о жизни, Университет “Сириус”; Институт общей генетики им. Н.И. Вавилова РАН; Центр генетики и генетических технологий, Московский государственный университет им. М.В. Ломоносова

Автор, ответственный за переписку.
Email: an_tati@mail.ru
Россия, Сочи; Россия, Москва; Россия, Москва

А. Б. Малярчук

Институт общей генетики им. Н.И. Вавилова РАН; Центр генетики и генетических технологий, Московский государственный университет им. М.В. Ломоносова

Автор, ответственный за переписку.
Email: sasha-m98@mail.ru
Россия, Москва; Россия, Москва

В. Е. Родинкова

Институт археологии РАН

Автор, ответственный за переписку.
Email: vlasta2004@mail.ru
Россия, Москва

А. Д. Сошкина

Институт общей генетики им. Н.И. Вавилова РАН; Центр генетики и генетических технологий, Московский государственный университет им. М.В. Ломоносова

Автор, ответственный за переписку.
Email: anna.soshkina91@gmail.com
Россия, Москва; Россия, Москва

Е. В. Рождественских

Центр генетики и наук о жизни, Университет “Сириус”

Автор, ответственный за переписку.
Email: l.i.r.o@mail.ru
Россия, Сочи

М. В. Добровольская

Институт археологии РАН

Автор, ответственный за переписку.
Email: mk_pa@mail.ru
Россия, Москва

Е. И. Рогаев

Центр генетики и наук о жизни, Университет “Сириус”; Центр генетики и генетических технологий, Московский государственный университет им. М.В. Ломоносова; Медицинская школа Чан Массачусетского университета, департамент психиатрии

Автор, ответственный за переписку.
Email: rogaev.ei@talantiuspeh.ru
Россия, Сочи; Россия, Москва; США, Шрусбери

Список литературы

  1. Гавритухин И.О. Хронология пражской культуры // Труды VI Международного Конгресса славянской археологии. Т. 3 / Отв. ред. В. В. Седов. М., 1997. С. 39–52.
  2. Гавритухин И.О., Щеглова О.А. Хронология начальных фаз памятников волынцевского типа // Гапоновский клад и его культурно-исторический контекст. М.: ИА РАН, 1996 (Раннеславянский мир. Археология славян и их соседей; вып. 3). С. 133–135.
  3. Клещенко Е.А., Решетова И.К. Палеоантропологические материалы в реконструкциях образа жизни и погребальной обрядности раннесредневекового населения Восточной Европы. М.: ИА РАН, 2019. 224 с.
  4. Обломский А.М., Щеглова О.А. Некоторые особенности культуры памятников волынцевского типа и спорные вопросы их происхождения // Гапоновский клад и его культурно-исторический контекст. М.: ИА РАН, 1996 (Раннеславянский мир. Археология славян и их соседей; вып. 3). С. 131–133.
  5. Комар А.В. Поляне и северяне // Древнейшие государства Восточной Европы. 2010 г. Предпосылки и пути образования Древнерусского государства. М.: Русский Фонд Содействия Образованию и Науке, 2012. С. 128–191.
  6. Родинкова В.Е. Раннеславянские памятники Среднего Поднепровья и Днепровского Левобережья с датирующими находками // Гапоновский клад и его культурно-исторический контекст. М.: ИА РАН, 1996 (Раннеславянский мир. Археология славян и их соседей; вып. 3). С. 155–162.
  7. Сыроватко А.С., Клещенко Е.А. Грунтовые погребения-кремации XII века: новые исследования курганного могильника Кременье // Археология Подмосковья: материалы науч. семинара. Вып. 13. М.: ИА РАН, 2017. С. 45–56.
  8. Шнеевайс Й. Керамика как свидетельство идентичности и культурного трансфера? Саксонская и славянская керамика VIII–X вв. в Нижнем Поэльбье // Европа от Латена до Средневековья: варварский мир и рождение славянских культур / Отв. ред. В.Е. Родинкова, О.С. Румянцева. М.: ИА РАН, 2017 (Раннеславянский мир. Археология славян и их соседей; вып. 19). С. 90–102.
  9. Этнокультурная карта территории Украинской ССР в I тыс. н.э. / Отв. ред. В.Д. Баран. Киев: Наукова думка, 1985. 184 с.
  10. AmtDB [Электронный ресурс]. URL: https://amtdb.org/ (дата обращения: 15.05.2023).
  11. Andreeva T.V., Manakhov A.D., Gusev F.E. et al. Genomic Analysis of a Novel Neanderthal from Mezmaiskaya Cave Provides Insights into the Genetic Relationships of Middle Palaeolithic Populations // Scientific Reports. 2022. 12. 13016. https://doi.org/10.1038/s41598-022-16164-9
  12. De Barros Damgaard P., Marchi N., Rasmussen S. et al. 137 Ancient Human Genomes from across the Eurasian Steppes // Nature. 2018. V. 557. № 7705. P. 369–374.https://doi.org/10.1038/s41586-018-0094-2
  13. BLAST [Электронный ресурс]. URL: https://blast.ncbi.nlm.nih.gov (дата обращения: 15.05.2023).
  14. Eltsov.org [Электронный ресурс]. URL: http://eltsov.org (дата обращения: 17.01.1922).
  15. Gansauge M.T., Gerber T., Glocke I et al. Single-Stranded DNA Library Preparation from Highly Degraded DNA Using T4 DNA Ligase // Nucleic Acids Research. 2017. V. 45. Iss. 10. P. e79. https://doi.org/10.1093/nar/gkx033
  16. GenBank [Электронный ресурс]. URL: www.ncbi.nlm.nih.gov/genbank/
  17. (дата обращения: 15.05.2023).
  18. González-Fortes G., Tassi F., Trucchi E. et al. A Western Route of Prehistoric Human Migration from Africa into the Iberian Peninsula // Proceedings of the Royal Society. B: Biological Sciences. 2019. V. 286. Iss. 1895. 20182288. https://doi.org/10.1098/rspb.2018.2288
  19. Grela M., Jakubczak A., Kowalczyk M., Listos P., Gryziń-ska M. Effectiveness of Various Methods of DNA Isolation from Bones and Teeth of Animals Exposed to High Temperature // Journal of Forensic and Legal Medicine. 2021. V. 78. 102131. https://doi.org/10.1016/j.jflm.2021.102131
  20. Ian Logan – mtDNA [Электронный ресурс]. URL: http://www.ianlogan.co.uk (дата обращения: 15.05.2023).
  21. Jónsson H., Ginolhac A., Schubert M., Johnson P.L.F., Orlando L. MapDamage2.0: Fast Approximate Bayesian Estimates of Ancient DNA Damage Parameters // Bioinformatics. 2013. 29. P. 1682–1684. https://doi.org/10.1093/bioinformatics/btt193
  22. Juras A., Ehler E., Chyleński M. et al. Maternal Genetic Origin of the Late and Final Neolithic Human Populations from Present-Day Poland // American Journal of Physical Anthropology. 2021. V. 176. Iss. 2. P. 223–36. https://doi.org/10.1002/ajpa.24372
  23. Katoh K., Standley D.M. MAFFT Multiple Sequence Alignment Software Version 7: Improvements in Performance and Usability // Molecular Biology and Evolution. 2013. V. 30. Iss. 4. P. 772–780. https://doi.org/10.1093/molbev/mst010
  24. Knipper C., Mittnik A., Massy K. et al. Female Exogamy and Gene Pool Diversification at the Transition from the Final Neolithic to the Early Bronze Age in Central Europe // Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America. 2017. V. 114. № 38. P. 10083–10088. https://doi.org/10.1073/pnas.1706355114
  25. Kristiansen K. Archaeology and the genetic revolution in European prehistory. Cambridge: Cambridge University Press, 2022. 76 p.
  26. Kumar S., Stecher G., Li M., Knyaz Ch., Tamura K. MEGA X: Molecular Evolutionary Genetics Analysis across Computing Platforms // Molecular Biology and Evolution. 2018. V. 35. Iss. 6. P. 1547–1549. https://doi.org/10.1093/molbev/msy096
  27. Li H., Durbin R. Fast and Accurate Short Read Alignment with Burrows-Wheeler Transform // Bioinformatics. 2009. V. 25. Iss. 14. P. 1754–1760. https://doi.org/10.1093/bioinformatics/btp324
  28. Loogväli E.-L., Roostalu U., Malyarchuk B.A. et al. Disuniting Uniformity: A Pied Cladistic Canvas of MtDNA Haplogroup H in Eurasia // Molecular Biology and Evolution. 2004. V. 21. Iss. 11. P. 2012–2021. https://doi.org/10.1093/molbev/msh209
  29. Margaryan A., Lawson D.J., Sikora M. et al. Population Genomics of the Viking World // Nature. 2020. V. 585. № 7825. P. 390–396. https://doi.org/10.1038/s41586-020-2688-8
  30. Nikitin A.G., Potekhina I., Rohland N. et al. Mitochondrial DNA Analysis of Eneolithic Trypillians from Ukraine Reveals Neolithic Farming Genetic Roots // PLOS ONE. 2017. V. 12. № 2. P. e0172952. https://doi.org/10.1371/journal.pone.0172952
  31. O’Sullivan N., Posth C., Coia V. et al. Ancient Genome-Wide Analyses Infer Kinship Structure in an Early Medieval Alemannic Graveyard // Science Advances. 2018. V. 4. № 9. P. 1262. https://doi.org/10.1126/sciadv.aao1262
  32. Olalde I., Brace S., Allentoft M.E. et al. The Beaker Phenomenon and the Genomic Transformation of Northwest Europe // Nature. 2018. V. 555. № 7695. P. 190–196. https://doi.org/10.1038/nature25738
  33. Olasz J., Seidenberg V., Hummel S. et al. DNA Profiling of Hungarian King Béla III and Other Skeletal Remains Originating from the Royal Basilica of Székesfehérvár // Archaeological and Anthropological Sciences. 2019. V. 11. № 4. P. 1345–1357. https://doi.org/10.1007/s12520-018-0609-7
  34. Ottoni C., Koon H.E.C., Collins M.J. et al. Preservation of Ancient DNA in Thermally Damaged Archaeological Bone // Naturwissenschaften. 2009. V. 96. № 2. P. 267–278.https://doi.org/10.1007/s00114-008-0478-5
  35. Ottoni C., Primativo G., Kashani B.H. et al. Mitochondrial Haplogroup H1 in North Africa: An Early Holocene Arrival from Iberia // PLOS ONE. 2010. V. 5. № 10. P. e13378. https://doi.org/10.1371/journal.pone.0013378
  36. Översti S., Majander K., Salmela E. et al. Human Mitochondrial DNA Lineages in Iron-Age Fennoscandia Suggest Incipient Admixture and Eastern Introduction of Farming-Related Maternal Ancestry // Scientific Reports. 2019. 9. 16883.https://doi.org/10.1038/s41598-019-51045-8
  37. PhyloTree – mtDNA tree Build [Электронный ресурс]. URL: http://www.phylotree.org (дата обращения: 15.05.2023).
  38. Robinson P., Zemo jtel T. Integrative Genomics Viewer (IGV): Visualizing Alignments and Variants // In Computational Exome and Genome Analysis. New York, 2018. P. 233–245. https://doi.org/10.1201/9781315154770-17
  39. Rogaev E.I., Grigorenko A.P., Moliaka Y.K. et al. Genomic Identification in the Historical Case of the Nicholas II Royal Family // Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America. 2009. V. 106. № 13. P. 5258–5263.https://doi.org/10.1073/pnas.0811190106
  40. Roostalu U., Kutuev I., Loogväli E.L. et al. Origin and Expansion of Haplogroup H, the Dominant Human Mitochondrial DNA Lineage in West Eurasia: The Near Eastern and Caucasian Perspective // Molecular Biology and Evolution. 2007. V. 24. Iss. 2. P. 436–448. https://doi.org/10.1093/molbev/msl173
  41. Saag L., Vasilyev S.V., Varul L. et al. Genetic Ancestry Changes in Stone to Bronze Age Transition in the East European Plain // Science Advances. 2021. V. 7. № 4. P. 6535. https://doi.org/10.1126/sciadv.abd6535
  42. Schubert M., Lindgreen S., Orlando L. AdapterRemoval v2: Rapid Adapter Trimming, Identification, and Read Merging // BMC Research Notes (BioMed Central Research Notes). 2016. V. 9. P. 88. https://doi.org/10.1186/s13104-016-1900-2
  43. Stolarek I., Handschuh L., Juras A. et al. Goth Migration Induced Changes in the Matrilineal Genetic Structure of the Central-East European Population // Scientific Reports. 2019. V. 9. P. 6737. https://doi.org/10.1038/s41598-019-43183-w
  44. Szeifert B., Gerber D., Csáky V. et al. Tracing Genetic Connections of Ancient Hungarians to the 6th–14th Century Populations of the Volga-Ural Region // Human Molecular Genetics. 2022. V. 31. № 19. P. 3266–3280.https://doi.org/10.1093/hmg/ddac106
  45. Tassi F., Vai S., Ghirotto S. et al. Genome Diversity in the Neolithic Globular Amphorae Culture and the Spread of Indo-European Languages // Proceedings of the Royal Society. B: Biological Sciences. 2017. V. 284. Iss. 1867. P. 20171540. https://doi.org/10.1098/rspb.2017.1540
  46. Van Oven M., Kayser M. Updated Comprehensive Phylogenetic Tree of Global Human Mitochondrial DNA Variation // Human Mutation. 2009. V. 30. № 2. P. e386–e394. https://doi.org/10.1002/humu.20921
  47. Wang Ch.Ch., Posth C., Furtwängler A. et al. Genome-Wide Autosomal, MtDNA, and Y Chromosome Analysis of King Bela III of the Hungarian Arpad Dynasty // Scientific Reports. 2021. V. 11. P. 19210. https://doi.org/10.1038/s41598-021-98796-x
  48. Weissensteiner H., Pacher D., Kloss-Brandstätter A. et al. HaploGrep 2: Mitochondrial Haplogroup Classification in the Era of High-Throughput Sequencing // Nucleic Acids Research. 2016. V. 44. № W1. P. W58–W63. https://doi.org/10.1093/nar/gkw233
  49. YFull – MTree 1.02 [Электронный ресурс]. URL: https://www.yfull.com/mtree/ (дата обращения: 15.05.2023).

Дополнительные файлы


© Т.В. Андреева, А.Б. Малярчук, В.Е. Родинкова, А.Д. Сошкина, Е.В. Рождественских, М.В. Добровольская, Е.И. Рогаев, 2023